银行保函保证金是指在经济活动中，为确保合同履约的一种担保方式。当甲方与乙方达成合作协议后，乙方需要提供一定金额作为保证金，以解决在合同执行过程中产生的争议及损失赔偿问题。
通常情况下，由乙方承担银行保函保证金。这是因为乙方作为合作方，在合同执行过程中具有一定的不确定性，比如无法确定是否能按时交付货物或完成工程等。因此，甲方要求乙方提供保证金，以确保在合同履约过程中能得到补偿。
保证金金额的决定因素包括合同金额、风险评估和业务规模等。对于较大规模的项目，保证金金额一般会相对较高；而对于低风险或小额交易，保证金金额则可以适当降低。此外，一般还涉及到双方的谈判和协商，以达成双方都能接受的金额。
保证金通常有两种用途。一是作为赔偿金，当乙方违约或无法履行合同时，甲方可以据此进行索赔；二是作为解决争议的资金，当项目发生纠纷时，双方可以通过第三方机构进行鉴定，并由保证金来支付相关费用。
在合同期满或履约完毕后，如果乙方没有违约，保证金将会被退还给乙方。退还保证金的程序一般需要经过甲方的确认和审核，确保没有任何纠纷或争议存在。
银行保函是由银行出具的担保文件，用于确保合同履行。保函本身并不直接涉及到保证金的支付，但保函中往往会提到乙方需向甲方提供一定的保证金。因此，可以说银行保函与保证金之间存在一定的联系和依存关系。
银行保函保证金是一种常见的合同担保方式，它能够在经济活动中确保合同的履约和风险的控制。由于各种因素的影响，保证金金额和支付责任往往需要双方通过协商来确定，并以书面形式明确记录在合同中。
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