预付款保函是指在合同签订之前，甲方向乙方提供一定金额的保证金，以确保乙方履行合同的义务。预付款保函费是指甲方需要支付给保函发行方的费用。
预付款保函费的计算一般包括以下几个方面：
1. 保函金额：预付款保函的金额通常是合同金额的一定比例。具体比例根据双方协商确定，一般在10%~30%之间。
2. 保函期限：预付款保函的期限通常与合同履行期限相同。保函期限越长，保函费用越高。
3. 保函费率：保函费率是指保函金额的一定比例。一般来说，保函费率越高，保函费用越高。
根据以上几个因素，可以用以下算法计算预付款保函费：
预付款保函费=保函金额×保函费率×保函期限
举例来说，假设甲方与乙方签订了合同，合同金额为100万元，双方协商决定预付款保函金额为合同金额的20%，保函期限为3个月，保函费率为1%。
预付款保函费=100万元×20%×1%×3个月=6000元。
需要注意的是，上述算法仅为一种常见的计算方式，具体的保函费用还受其他因素的影响，比如保函发行方的收费标准、合同的复杂程度等。
此外，预付款保函费一般需要甲方承担。甲方可以直接支付给保函发行方，也可以从预付款中扣除。
总之，预付款保函费是根据保函金额、保函期限和保函费率计算得出的费用。在签订合同时，双方需要根据具体情况协商确定保函费用，并明确费用承担方。
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