预付款保函是一种担保方式，由银行或保险公司向受益人保证，保证指定的一方在合同履行过程中未能按照合同约定方式履行合同义务时，履行有关合同义务的一种信用担保责任。
预付款保函是在合同签订之前由买方向卖方提供的保函，用于确保买方支付预付款时的信用担保。预付款保函通常要求买方在签署保函时存入一定金额的保证金，以确保买方的认真履行合同义务。
保证金的存入金额根据具体合同内容和保函金额而定，一般为保函金额的5%至10%。保证金的存入可以是现金、银行承兑汇票、保险公司担保函等形式。买方在保函期限届满后，如果合同正常履行，保证金将无息退还给买方。
在实际操作中，预付款保函需要存保证金的规定并不是硬性规定，具体是否需要存保证金还要根据合同和具体银行或保险公司的要求而定。一般情况下，如果合同金额较大或风险较高，银行或保险公司会要求买方存入保证金。
总的来说，预付款保函需要存保证金的情况并不是绝对的，具体情况要具体分析。在签订合同和申请预付款保函时，买方应该了解相关规定并与银行或保险公司充分沟通，以确保合同履行顺利。
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