在建筑工程中，工程担保保函被广泛应用于担保承包人按时完工、履行合同义务和质量责任。然而，随着项目复杂性和合同纠纷数量的增加，工程担保保函纠纷也逐渐浮出水面。
近期，某工程公司甲与其供应商乙签订了建筑工程合同，要求乙提供工程担保保函作为合同履约的保证措施。然而，在工程过程中，发生了一系列质量问题，导致工程延误和额外费用产生。此时，甲方根据合同条款要求乙方赔偿损失，并要求执行工程担保保函。
纠纷核心在于工程担保保函的有效性与适用范围。甲方主张，工程担保保函是对乙方履约的担保，故可直接执行，而乙方则指出，由于工程存在质量问题是甲方的原因，故甲方无权要求执行工程担保保函。
根据相关法律规定，当工程出现质量问题时，甲方应在一定期限内通知乙方进行整改，并提供合理的配合与协助。若乙方未在规定时间内完成整改或拒绝履行，甲方有权扣除保函金额以及追偿损失。
针对本案，应当明确工程延误和额外费用是否由甲方的过错导致。如若是，甲方可能无法要求执行保函。另外，还需要分析工程担保保函的具体条款，确保甲方的诉求符合保函文件的范围。
根据法院的最终判决，仔细分析了双方的主张、证据以及保函文件的相关条款内容。经审理后，法院认为甲方未尽责以及工程担保保函中的限制条件适用，故裁决不支持甲方要求执行工程担保保函的申请。
对于工程担保保函纠纷案件，各方应在签订合同时明确保函的约定和范围，并在工程过程中严格履行合同义务。同时，及时采取措施解决可能导致纠纷的问题，以减少双方的损失。
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