工程保函手续费是在进行工程保函业务时，银行或保险公司向客户收取的一定比例的费用。工程保函是建筑工程、机械设备采购和施工等合同中常见的一种担保形式，其目的是确保受益人能够按约定获得相应的赔偿。
工程保函手续费通常根据保函金额的一定比例来进行计算。具体手续费率根据不同银行或保险公司的规定而有所差异，但一般会在保函金额的0.5%到1.5%之间。例如，如果保函金额为100万元，手续费率为1%，那么手续费就是10000元。
工程保函手续费的支付方式可以根据双方协商来决定。一般情况下，手续费可以一次性支付，也可以分期支付。对于较大金额的保函业务，分期支付是一个常见的选择。根据合同约定，分期支付的手续费可以根据施工进度或工程款支付情况来确定分期比例和时间。
工程保函手续费的入账方式一般有两种：一种是直接支付给银行或保险公司，另一种是由施工单位在办理保函时先行垫付，并在工程款结算时将手续费从工程款中扣除后支付给银行或保险公司。
直接支付给银行或保险公司是工程保函手续费的常见方式。在办理保函时，客户需向银行或保险公司支付相应金额的手续费，然后银行或保险公司会确认收款，并出具相应的保函文件。
在某些情况下，工程保函手续费可以由施工单位先行垫付，并在后续工程款结算时从工程款中扣除进行支付。这种方式通常适用于较大规模的工程项目，由于手续费较高，客户可能无法一次性支付所有费用，因此选择将手续费与工程款结算挂钩。
工程保函手续费是进行工程保函业务时不可避免的一项费用，根据保函金额的比例进行计算。手续费的支付方式可以一次性支付或分期支付，而入账方式可以直接支付给银行或保险公司，也可以从工程款中扣除进行支付。
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