投标保证金是指投标人为了确认其在招标工程中的真实意愿和尽职调查招标工程，按照项目招标文件规定应当预先交纳一定数额的款项。投标保证金的目的是确保投标人对招标文件的认真审阅，并体现其参与招标的诚意，防止无谓的投标行为。投标保证金通常需要在投标截止日期前按规定的银行账号缴纳。
保函是招标文件要求承包商提供给业主的一种金融担保方式。它是由合格的银行或保险机构发出的书面承诺，保证如承包商在工程项目中未履行其所签订的合同义务，那么该银行或保险机构会根据合同规定，向业主支付一定金额的赔偿金。保函可以作为替代投标保证金的形式存在，被越来越多的企业接受和使用。
投标保证金与保函都是为了确保投标人的诚意和履约能力。它们有相似的功能，但也存在一些不同之处。首先，投标保证金通常是实际缴纳一笔资金，而保函则是银行或保险机构发出的一种承诺文件。其次，投标保证金在招标工程中被冻结，直到确定中标人或结束投标流程，而保函通常在一定的合同履行期限内有效。另外，投标保证金可以根据工程规模和要求的金额进行调整，而保函的金额则由银行或保险机构根据其信用额度和承担风险来确认。
选择投标保证金还是保函需要充分考虑自身的实际情况和项目需求。如果企业具备足够的流动资金，并且希望避免额外的费用，那么选择投标保证金可能更为适合。但是，如果企业资金状况较紧张，或者对于某些特定工程项目需要提供更强的担保方式，那么选择保函可能更为合适。最终的选择取决于企业的具体情况和项目要求。
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