备用证和银行保函是在商业交易中常见的两种担保方式。备用证是指银行承诺在合同履行不符合约定时，按照受益人要求支付一定金额给对方，以弥补其损失。而银行保函也是一种承诺，但是其主要目的是确保约定的义务得到履行。尽管备用证和银行保函都起到了保障交易的作用，但它们之间存在一些重要的区别。
备用证通常用于国际贸易中，特别是在大额交易中，以确保卖方的履约能力。而银行保函则更广泛地应用于各类商业交易，如施工工程、采购合同等。备用证适用性相对较窄，而银行保函在各个领域都有被广泛运用的趋势。
备用证一般需要保证一定比例的交易价值，通常在货款的10%-15%之间。而银行保函的金额直接对应于合同中规定的义务履行金额，根据实际交易情况，可以灵活地设定。
备用证的付款方式是通过先行付款的方式，即当受益人请求付款时，银行将立即支付相应金额给受益人。而银行保函的付款方式是按照约定的条件和程序履行，常见的方式包括直接支付、按指令支付等。
备用证适用于交易中的卖方，主要作为卖方信用的一种表现形式。而银行保函则既可以适用于买方，也可以适用于卖方，具体取决于交易各方的需求和约定。
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