投标保证金是指企业或个人在参与招投标活动时需要缴纳的一定金额的资金，作为对投标方履行合同义务的一种经济措施。保函则是由保险公司、银行或其他金融机构出具的保证书，用以确保承诺一方根据合同约定履行相应义务。
投标保证金主要应用于招投标活动中，目的是减少不良投标者的参与，提高投标的质量和可靠性。而保函则广泛应用于各类合同中，包括建筑工程、国际贸易等领域，作为确保履约的方式之一。
投标保证金通常有两种退还方式：一是在中标后退还给未中标的投标方；二是在招标项目结束后按照规定的程序和时间限制退还给全部投标方。而保函在履约期满、解除合同、完成付款等情况下，根据相关合同约定和实际情况进行退还。
投标保证金的金额通常由招标人事先确定，并在招标文件中明确规定。其数额较小，一般为投标金额的2%~5%左右。而保函的金额则需要根据具体的合同约定和风险评估进行确定，通常会覆盖合同价款的一定比例。相比之下，保函的金额较大，但是保函的费用也要高于投标保证金。
投标保证金在国内法律中没有明确的法定地位，其权益保护主要依靠相关招标投标法律法规的规定。而保函具有法律效力，一旦承兑、签署后即对双方具有约束力，一方违约将面临法律责任。
投标保证金的风险主要集中在招标人无故扣除或迟迟不予退还的问题上。而保函则存在承兑银行信用风险、保函索赔的诉讼成本和时间成本等风险。为了控制风险，投标方、招标人以及相关金融机构需要加强信息披露和合同约定。
在选择投标保证金还是保函时，投标方需要综合考虑多个因素，包括具体的招投标项目要求、合同履行情况、费用成本等。同时，也需要与招标人或合作方进行充分沟通，明确双方的意愿和能力，以做出正确的选择。
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