保函工程款是指在房地产开发或建筑工程中，业主要求施工方提供的一种担保方式。它相当于一张银行的保证书，表示施工方将根据合同约定按时完工，并承担由于施工延误、质量问题等引起的责任。
业主支付保函工程款是为了保护自身的权益。通过要求施工方提供保函，可以降低工程风险，确保工程按时交付并符合合同约定的质量标准。
具体的比例应当根据工程的性质和合同的约定而定。常见的做法是根据工程进度来支付保函工程款，通常分为若干个阶段，每个阶段支付一定比例的工程款。
确定阶段支付比例需要考虑多方面因素，包括工程的复杂性、施工方的信誉度、付款能力以及业主对于工程进度和质量的要求等。一般来说，阶段支付比例越高，则对施工方的监督力度也越大。
为了保证业主支付的保函工程款的安全，可以采取一些措施，例如与具有良好信誉的金融机构合作，选择可靠的保险公司提供保函，或者在支付过程中进行逐步验收，确保资金与工程进展同步。
最后一笔保函工程款通常应在工程完工并经过验收后支付。在这个阶段，业主需要对工程进行全面检查，确保所有项目都符合合同约定，没有任何质量问题。
除了上述内容外，还需要注意以下几点：
